台湾与澎湖本岛之间的交通有航空与海路两种，班次密集，七、八月旅澎湖风光5游旺季，机票几乎都被旅行社预订一空，因此若自行前往得提前二个月预订。

    航空

　　1．台北、台中、嘉义、台南、高雄、屏东等地都有班机往来马公机场，高雄还有班机直飞七美及望安。

　　2．各航空公司航线如下：台北←→马公有远东、复兴、立荣；台中←→马公有华信、立荣；嘉义←→马公有复兴、立荣、远东、华信；高雄←→七美有华信、立荣航空；高雄←→望安有立荣；马公←→七美有立荣及华信航空。

　　3．机场至马公市区可搭乘公车或计程车，后者车资约350~400元，若事先向车行叫车，则在300元上下。

　　海运

　　嘉义、高雄两地分别有船班往来澎湖；海王星号/嘉义（布袋）←→锁港，航程约90分钟，此航线冬季停航；台华轮/高雄←→马公，航程约4小时。

　　岛际交通

　　马公与望安、七美之间有固定交通船往来，其余离岛则有私人经营的船班。

　　陆上交通

　　澎湖本岛有公车行驶，但班次不多，加上岛内公路网简明易行，路况极佳，一般游客多租汽机车或包计程车代步。其中，本岛风景线从马公市出发，先经风柜，到林投公园、果叶村，再至白沙、通梁古榕、跨海大桥、西屿等地，全程约74.5公里。若想租车，须备身份证及驾照，马公市区租车行林立；欲知公车详细路线可洽澎湖县公共车船管理处，包车则可洽计程车同业公会（06）927-6742。每周六及周日车管处会发四班旅游公车，停留地点包含马公机场、澎湖水族馆、北海游客服务中心、通梁风景区、西屿西台古堡，惟班次不多，最好先电洽发车时间。