亳州是汉代著名医学家华佗的故乡，享有“药都”之誉。它与河南禹州（今禹县）、辉州（今 辉县）、河北祁州（今安国县）并称四大药都，是中国四大药材集散地之一。清末，亳州已经成了药商云集，这里盛产中药材，药材市场由来已久。主要品种有亳芍、亳菊、亳花粉、亳桑皮等。
亳州拥有全国最大的中药材市场——中国药材交易中心于1994年建成。在交易中心上市的药材品种多达2000余种。每年大量的药商云集在此。到亳州，可买点具有保健功效的中药材，烹饪提味或是馈赠亲友都很适宜。
与药材中心相配套的中国中药材期货交易所、中国中药材信息中心近年来，在亳州陆续建立起来。1995年，江泽民总书记欣然为亳州题词：“华佗故里，药材之乡”。

同时，亳州所产的国宴用酒“古井贡酒”享誉九州，驰名中外。近年还建成了中国酒文化博物馆，展品丰富，陈列考究，充分表现出中国酒文化的博大精深，源远流长；亳州下辖的蒙城县拥有中国最大的良种牛产地；毫州剪纸独具特色，融合了中国南北方剪纸艺术的风格；亳州土特产还有义门苔干、铜关粉皮、观堂大蒜、苏赵梨、万寿绸被面、狗皮褥子、布鞋等，在市区地特产店可生产地和各广大商场都能很方便的购买到。