航空

南通机场位于市区东北12公里的通州市兴东镇。目前主要开通有南通至广州、北京、厦门、深圳、大连、成都、武汉、温州、青岛、南京等地航线。

机场交通：机场与民航售票处之间有班车来往，市民航售票处，位于市区人民中路9号。工农路民航售票处，位于工农路241号。

铁路

南通火车站位于市钢闸区。经过车次不多，直达列车可通往北京、上海、南京、重庆北、太原等城市。
市内可以乘坐32、41、44路公交车到达。

小贴士：周边城市前往南通乘列车需时较长，建议乘坐汽车，特别是上海地区游客，火车行程约7小时，而乘汽车则只需两个多小时即可达。

公路

前往南通：上海出发，可在上海长途汽车客运总站和上海长途客运南站乘车，两站每天都有很多班次发南通，苏通大桥开通后，这些车都改走苏通大桥，往返行程比原来缩短2.5小时，大概约2小时左右可达。票价约50元。

苏州出发，一般在苏州汽车北站乘车，每半小时一班。杭州方向在杭州汽车北站乘车，票价90元。

自驾：上海出发可从A5往西北－沿江高速－苏嘉杭高速路口－上苏通大桥即到。

苏州出发可从苏嘉杭高速（常熟方向）－沿江高速－苏通大桥。

南通长途汽车站：即南通汽车站，位于人民西路350号。主要有发周边各地长途汽车，也可乘坐境内市、县区班车，是南通旅游最重要的交通枢纽。市内乘坐公交8路车至三元桥，下车向南不到100米可到。另有32路公交来往与火车站之间。

水运

南通港是我国十大港口之一，也是长江水系江河运输直达中转的枢纽。南通与上海每天有两班快艇往返。上海－汉口、上海－重庆的江轮均停靠南通。从市区、长途车站到南通港可乘4路车直达。

“南通”往南因长江阻隔，其实是“南不通”，要通过通沙（南通市天生港--张家港市西界港）、通常（通州市省军区农场--常熟市浒浦镇）、海太（海门市江心沙农场--太仓市鹿河镇）、海崇（海门市青龙港－上海市崇明县牛棚港）汽渡与苏南和上海交往。世界上跨度最大的“苏（州）（南）通长江大桥”2008年建成通车后，彻底改变了“南不通”的历史。